MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Methanobacterium sp. SWAN-1 chromosome

Total Repeats: 55991

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_015574	TTG	2	6	23443	23448	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333986263
502	NC_015574	TAT	2	6	23551	23556	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333986263
503	NC_015574	ATTT	2	8	23624	23631	25 %	75 %	0 %	0 %	333986263
504	NC_015574	AG	3	6	23686	23691	50 %	0 %	50 %	0 %	333986263
505	NC_015574	ATTT	2	8	23708	23715	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
506	NC_015574	TA	3	6	23774	23779	50 %	50 %	0 %	0 %	333986264
507	NC_015574	A	6	6	23788	23793	100 %	0 %	0 %	0 %	333986264
508	NC_015574	A	6	6	23883	23888	100 %	0 %	0 %	0 %	333986264
509	NC_015574	CTCAAC	2	12	23993	24004	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	333986264
510	NC_015574	AGA	2	6	24136	24141	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333986264
511	NC_015574	TAAG	2	8	24147	24154	50 %	25 %	25 %	0 %	333986264
512	NC_015574	CAG	2	6	24195	24200	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333986264
513	NC_015574	CAG	2	6	24207	24212	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333986264
514	NC_015574	A	6	6	24245	24250	100 %	0 %	0 %	0 %	333986264
515	NC_015574	TCA	2	6	24323	24328	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333986264
516	NC_015574	CAA	2	6	24459	24464	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	333986264
517	NC_015574	GAA	2	6	24503	24508	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333986264
518	NC_015574	TAA	2	6	24522	24527	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333986264
519	NC_015574	TTC	2	6	24681	24686	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333986264
520	NC_015574	AC	3	6	24730	24735	50 %	0 %	0 %	50 %	333986264
521	NC_015574	CAG	2	6	24818	24823	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333986264
522	NC_015574	CAG	2	6	25026	25031	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333986264
523	NC_015574	TGA	2	6	25180	25185	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333986264
524	NC_015574	CAGG	2	8	25203	25210	25 %	0 %	50 %	25 %	333986264
525	NC_015574	TGA	2	6	25219	25224	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333986264
526	NC_015574	GCA	2	6	25294	25299	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
527	NC_015574	A	8	8	25335	25342	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
528	NC_015574	TGG	2	6	25377	25382	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333986265
529	NC_015574	TTG	2	6	25473	25478	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333986265
530	NC_015574	AGA	2	6	25500	25505	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333986265
531	NC_015574	GAG	2	6	25508	25513	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	333986265
532	NC_015574	GGC	2	6	25590	25595	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333986265
533	NC_015574	GTA	2	6	25610	25615	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333986265
534	NC_015574	GAG	2	6	25721	25726	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	333986265
535	NC_015574	AAGTT	2	10	25854	25863	40 %	40 %	20 %	0 %	333986265
536	NC_015574	TGGT	2	8	25891	25898	0 %	50 %	50 %	0 %	333986265
537	NC_015574	TGA	2	6	25945	25950	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333986265
538	NC_015574	TGA	2	6	25966	25971	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333986265
539	NC_015574	GAT	2	6	26000	26005	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333986265
540	NC_015574	T	6	6	26235	26240	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
541	NC_015574	T	7	7	26279	26285	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
542	NC_015574	TATAA	2	10	26293	26302	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
543	NC_015574	T	9	9	26342	26350	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
544	NC_015574	TCT	3	9	26376	26384	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
545	NC_015574	A	7	7	26410	26416	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
546	NC_015574	ACG	2	6	26623	26628	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333986266
547	NC_015574	CAT	2	6	26713	26718	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333986266
548	NC_015574	AGC	2	6	26724	26729	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333986266
549	NC_015574	ATA	2	6	26730	26735	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333986266
550	NC_015574	A	6	6	26768	26773	100 %	0 %	0 %	0 %	333986266
551	NC_015574	AAT	2	6	26789	26794	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333986266
552	NC_015574	TGG	2	6	26807	26812	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333986266
553	NC_015574	CAGA	2	8	26826	26833	50 %	0 %	25 %	25 %	333986266
554	NC_015574	GAA	2	6	26841	26846	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333986266
555	NC_015574	AAGA	2	8	26889	26896	75 %	0 %	25 %	0 %	333986266
556	NC_015574	A	6	6	26903	26908	100 %	0 %	0 %	0 %	333986266
557	NC_015574	AGG	2	6	26936	26941	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	333986266
558	NC_015574	A	6	6	26961	26966	100 %	0 %	0 %	0 %	333986266
559	NC_015574	A	6	6	27108	27113	100 %	0 %	0 %	0 %	333986266
560	NC_015574	ATT	2	6	27169	27174	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333986266
561	NC_015574	AC	3	6	27208	27213	50 %	0 %	0 %	50 %	333986266
562	NC_015574	GAG	2	6	27225	27230	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	333986266
563	NC_015574	A	7	7	27248	27254	100 %	0 %	0 %	0 %	333986266
564	NC_015574	AAG	2	6	27276	27281	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333986266
565	NC_015574	TTC	2	6	27328	27333	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333986266
566	NC_015574	A	6	6	27393	27398	100 %	0 %	0 %	0 %	333986266
567	NC_015574	AAG	2	6	27625	27630	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333986266
568	NC_015574	TTCA	2	8	27647	27654	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
569	NC_015574	ACC	2	6	27723	27728	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
570	NC_015574	AAG	2	6	27740	27745	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
571	NC_015574	TAAAA	2	10	27797	27806	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
572	NC_015574	TGT	2	6	27848	27853	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333986267
573	NC_015574	AAAC	2	8	27863	27870	75 %	0 %	0 %	25 %	333986267
574	NC_015574	TGG	2	6	27911	27916	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333986267
575	NC_015574	GAA	2	6	28038	28043	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333986267
576	NC_015574	T	8	8	28148	28155	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
577	NC_015574	T	6	6	28168	28173	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
578	NC_015574	TAC	2	6	28202	28207	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
579	NC_015574	TAT	2	6	28229	28234	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
580	NC_015574	TTTAA	2	10	28355	28364	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
581	NC_015574	AT	3	6	28389	28394	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
582	NC_015574	AT	3	6	28402	28407	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
583	NC_015574	ATAAA	2	10	28440	28449	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
584	NC_015574	A	7	7	28458	28464	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
585	NC_015574	AATTA	2	10	28476	28485	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
586	NC_015574	A	8	8	28485	28492	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
587	NC_015574	A	7	7	28499	28505	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
588	NC_015574	TTTC	2	8	28556	28563	0 %	75 %	0 %	25 %	333986268
589	NC_015574	GTA	2	6	28628	28633	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333986268
590	NC_015574	CGT	2	6	28690	28695	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333986268
591	NC_015574	TAT	2	6	28841	28846	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333986268
592	NC_015574	GTT	2	6	28869	28874	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333986268
593	NC_015574	TGT	2	6	28969	28974	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333986268
594	NC_015574	GAT	2	6	28995	29000	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333986268
595	NC_015574	TGT	2	6	29135	29140	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333986268
596	NC_015574	GTC	2	6	29189	29194	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333986268
597	NC_015574	CAT	2	6	29311	29316	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333986268
598	NC_015574	CCGT	2	8	29430	29437	0 %	25 %	25 %	50 %	333986268
599	NC_015574	GAT	2	6	29475	29480	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333986268
600	NC_015574	ATT	2	6	29481	29486	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333986268
601	NC_015574	TAT	2	6	29570	29575	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333986268
602	NC_015574	ATT	2	6	29583	29588	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333986268
603	NC_015574	GAT	2	6	29595	29600	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333986268
604	NC_015574	CAG	2	6	29647	29652	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333986268
605	NC_015574	TG	3	6	29669	29674	0 %	50 %	50 %	0 %	333986268
606	NC_015574	GCTG	2	8	29705	29712	0 %	25 %	50 %	25 %	333986268
607	NC_015574	CAG	2	6	29713	29718	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333986268
608	NC_015574	T	6	6	29778	29783	0 %	100 %	0 %	0 %	333986268
609	NC_015574	TCA	2	6	29835	29840	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
610	NC_015574	ATT	2	6	29846	29851	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
611	NC_015574	ATTTTT	2	12	29858	29869	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
612	NC_015574	T	8	8	29902	29909	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
613	NC_015574	AAG	2	6	29981	29986	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333986269
614	NC_015574	AT	3	6	30004	30009	50 %	50 %	0 %	0 %	333986269
615	NC_015574	CGT	2	6	30049	30054	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333986269
616	NC_015574	CATGG	2	10	30099	30108	20 %	20 %	40 %	20 %	333986269
617	NC_015574	CAT	2	6	30140	30145	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333986269
618	NC_015574	TCC	2	6	30180	30185	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	333986269
619	NC_015574	ATT	2	6	30210	30215	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333986269
620	NC_015574	AGCAC	2	10	30229	30238	40 %	0 %	20 %	40 %	333986269
621	NC_015574	AAG	2	6	30248	30253	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333986269
622	NC_015574	GCT	2	6	30306	30311	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333986269
623	NC_015574	TAAT	2	8	30313	30320	50 %	50 %	0 %	0 %	333986269
624	NC_015574	ATT	2	6	30321	30326	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333986269
625	NC_015574	TA	3	6	30512	30517	50 %	50 %	0 %	0 %	333986269
626	NC_015574	TCA	2	6	30562	30567	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333986269
627	NC_015574	ACAGTC	2	12	30732	30743	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	333986269
628	NC_015574	ATT	2	6	30786	30791	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333986269
629	NC_015574	TAT	2	6	30845	30850	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333986269
630	NC_015574	CCATA	2	10	30961	30970	40 %	20 %	0 %	40 %	333986269
631	NC_015574	ATC	2	6	30984	30989	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333986269
632	NC_015574	ATC	2	6	31059	31064	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333986269
633	NC_015574	ATT	2	6	31068	31073	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333986269
634	NC_015574	CTTT	2	8	31103	31110	0 %	75 %	0 %	25 %	333986270
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637	NC_015574	TAT	2	6	31188	31193	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333986270
638	NC_015574	TCT	2	6	31219	31224	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333986270
639	NC_015574	CTTA	2	8	31227	31234	25 %	50 %	0 %	25 %	333986270
640	NC_015574	GAT	2	6	31305	31310	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333986270
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670	NC_015574	AT	3	6	32692	32697	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
671	NC_015574	TA	3	6	32743	32748	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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673	NC_015574	GGT	2	6	32783	32788	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
674	NC_015574	T	6	6	32822	32827	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
675	NC_015574	TTA	2	6	32861	32866	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
676	NC_015574	T	6	6	32883	32888	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
677	NC_015574	TG	3	6	32930	32935	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
678	NC_015574	TA	3	6	32993	32998	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
679	NC_015574	T	6	6	33028	33033	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
680	NC_015574	A	7	7	33052	33058	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
681	NC_015574	A	6	6	33110	33115	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
682	NC_015574	A	9	9	33129	33137	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
683	NC_015574	A	6	6	33139	33144	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
684	NC_015574	A	6	6	33149	33154	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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704	NC_015574	AAT	2	6	33687	33692	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
705	NC_015574	ATA	2	6	33725	33730	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
706	NC_015574	AAT	2	6	33744	33749	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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743	NC_015574	AAGGT	2	10	35475	35484	40 %	20 %	40 %	0 %	333986274
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749	NC_015574	ATT	2	6	35809	35814	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
750	NC_015574	TAA	3	9	35917	35925	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
751	NC_015574	AAG	2	6	35934	35939	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
752	NC_015574	AAT	2	6	36010	36015	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
753	NC_015574	TA	4	8	36039	36046	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
754	NC_015574	AAT	2	6	36104	36109	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
755	NC_015574	ACA	2	6	36116	36121	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
756	NC_015574	ATC	2	6	36148	36153	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
757	NC_015574	ATC	2	6	36168	36173	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
758	NC_015574	A	7	7	36202	36208	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
759	NC_015574	CAAA	2	8	36210	36217	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
760	NC_015574	A	6	6	36246	36251	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
761	NC_015574	GCA	2	6	36307	36312	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333986275
762	NC_015574	CTT	2	6	36371	36376	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333986275
763	NC_015574	CAT	2	6	36411	36416	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333986275
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